IDENTIFICACIÓN MOLECULAR DE BACTERIAS EN Eisenia foetida Savigny CULTIVADAS, CON POTENCIAL DE REMOCIÓN DE CONTAMINANTES ORGÁNICOS PERSISTENTES

Resumen

Se evaluó el uso de métodos cultivables para aislar y caracterizar genotípicamente las bacterias asociadas con el intestino de la lombriz de tierra (Eisenia foetida Savigny), identificando algunos géneros reportados con un potencial de remoción de contaminantes orgánicos persistentes (COPs). Las lombrices de tierra analizadas en adición con peat moss y estiércol de conejo a nivel de laboratorio, integraron un sistema de vermicompostaje que fue capaz de remover 96%, del contaminante decaclorobifenilo a una concentración de 200 mg kg^-1 durante 91 días. A partir de cepas bacterianas puras aisladas del tracto digestivo de la lombriz, se procedió a extraer el DNA genómico y se amplificó el gen 16S rDNA a partir del DNA extraído de las cepas, usando los primers fD1 (5´-AGAGTTTGATCCTGGCTCAG-3´) y rD1 (5´ AAGGAGGTGATCCAGCC-3´).
Todas las secuencias de las cepas fueron analizadas usando el programa BioEdit v.6 y alineadas con CLUSTAL W, los árboles filogenéticos fueron construídos a través del programa MEGA v.5.2, utilizando el modelo evolutivo Tamura-Nei. La posición taxonómica de la cepas fueron determinadas conforme a las secuencias parciales del gen cromosomal 16S rDNA de cepas bacterianas tipo, el cual identificó a los género Bacillus, Caryophanon, Staphylococcus, Pseudomonas.